Maart 1943, Bletchley Park, ten noorden van London. Terwijl de Tweede Wereldoorlog in alle hevigheid woedt, probeert een geniaal team de Enigma-code te kraken waarmee de Duitse vijand met elkaar communiceert om daarmee een ramp voor de Geallieerden te voorkomen. Tom Jericho (Dougray Scott) keert na een korte periode van afwezigheid terug op Bletchley en leert tot zijn verbazing dat de mooie Claire Romilly (Saffron Burrows) met wie hij een kortstondige relatie had, is verdwenen. Claire's huisgenoot Hester Wallace (Kate Winslet) helpt hem het mysterie van Claire's verdwijning te ontrafelen. Heeft Claire een aandeel gehad in het veranderen van de code door de Duitsers? Of is de zaak toch ingewikkelder dan zij denken?